Vivodyne認為,AI藥物研發的限制未必在於模型不夠大,而是缺乏受控、與人體高度相關的生物數據。 公司表示,在20種化療藥物測試中,肝臟模型預測人體藥物毒性的準確率為94%,氣道組織匹配人體組織行為的比例為96%,骨髓模型則達到100%一致;但這些仍屬公司公布的結果,並非獨立臨床驗證。
研究答案

Create a landscape editorial hero image for this Studio Global article: What problem does Vivodyne believe is limiting AI-driven drug discovery, how do its HIVE autonomous robotic labs address that problem by gro. Article summary: Vivodyne’s core claim is that AI drug discovery is constrained less by model size than by a shortage of controlled, human-relevant experimental data. Its proposed remedy is to use automated human-tissue experiments to me. Topic tags: general, general web, user generated. Style: premium digital editorial illustration, source-backed research mood, clean composition, high detail, modern web publication hero. Use reference image context only for broad subject, composition, and topical grounding; do not copy the exact image. Avoid: logos, brand marks, copyrighted characters, real person likenesses, fake screenshots, UI text, readable text, watermarks, charts with fa
Vivodyne的核心觀點很直接:AI藥物研發首先遇到的是數據問題,其次才是模型問題。
現時的AI系統可以快速提出新靶點、分子和實驗方案,但如果訓練數據主要來自動物、單一細胞、蛋白質,或者只是觀察性研究,模型便未必真正知道複雜人體組織遇到藥物後會有甚麼反應。Vivodyne行政總裁Andrei Georgescu曾表示,現時由AI設計的藥物,表現尚未明顯優於人類設計的藥物,原因之一正是可供模型學習的實驗室數據不足。25
公司的答案,是名為HIVE的模組化自動化實驗室平台:大規模培養人體組織,再自動給藥、監察和分析反應。
藥物研發模型或許可以發現某種生物特徵與疾病結果之間存在關聯,但這並不代表模型已經知道:當研究人員在特定劑量下改變某個生物條件,某種人體組織到底會發生甚麼事。
因此,Vivodyne把重點放在「擾動」(perturbation)上,即是刻意改變一個條件,再量度組織的反應。按公司的說法,這類受控實驗可以產生更貼近藥物研發需要的因果數據:如果施加X治療、使用Y劑量,Z組織便出現可量度的變化。Vivodyne形容,平台希望透過在人體組織上進行受控實驗,建立細胞層面的因果關係數據。2
這個分別相當重要。若模型學到的是不完整、或者與人體情況不吻合的生物學,它仍然可以對錯誤答案表現得非常有信心。Vivodyne並非認為大型模型沒有用,而是認為如果只把模型做大,卻沒有同步提升實驗數據的質素及人體相關性,效益可能相當有限。1725
HIVE結合機械人、微流體技術、組織工程、自動給藥系統,以及多種生物學讀數。Vivodyne表示,系統可以培養20種人體組織,然後施加藥物或其他生物擾動,並持續追蹤組織隨時間出現的變化。117
平台的核心之一是TissueDisk。按照公司介紹,這種裝置可以讓數以百計、互相獨立的人體組織同時培養和接受不同劑量測試。每個組織模型約含20萬至50萬個細胞,部分模型更包括可灌流、具組織專一性的三維血管網絡,讓藥物可以透過更接近生理狀況的方式輸送。24
實際流程大致如下:
這種做法,是把實驗室變成一套持續生產數據的系統,而不是一堆互不相連的單次測試。結果不只是「組織有沒有死亡」,還可以包括組織如何改變、何時開始改變、哪些細胞受到影響,以及不同劑量或藥物組合如何改變結果。
動物模型對研究全身性反應仍然有價值,但在動物身上有效的生物學機制,未必會在人類身上以相同方式運作。物種差異可以影響藥物代謝、毒性、免疫反應、疾病機制,以及多個器官之間的互動。
至於單細胞及蛋白質實驗,雖然能提供細緻資料,卻會移除多細胞組織及生理環境的一大部分。這些因素往往正正會左右藥物的實際效果。
這種落差亦有助解釋,為何一些在臨床前研究中看似有希望的候選藥物,到了人體開發階段仍然失敗。Vivodyne希望較早加入人體組織證據,讓部分安全性及療效問題在昂貴的病人試驗前被發現。113
不過,實驗室培養的人體組織始終不是完整的人體。這些模型未必可以完全重現全身藥代動力學、器官之間的訊號傳遞、長期免疫反應、病人之間的差異,或者疾病的所有特徵。因此,它們較適合被視為簡化實驗與臨床研究之間的橋樑,而不是臨床試驗的替代品。
Vivodyne表示,曾以20種化療藥物測試多種組織模型。公司稱,其肝臟模型預測人體藥物毒性的準確率為94%,氣道模型與人體組織行為的匹配率為96%,骨髓模型在該測試組合中則達到100%一致。17
這些數字值得留意,但需要小心解讀。現有資料顯示,這些是公司公布的效能聲稱;資料並未證明平台已經在多類藥物上完成大型、獨立及經同行評審的驗證,也沒有顯示HIVE在前瞻性比較中能提高藥物獲批率。
Vivodyne亦公布一個設有12個HIVE實驗室的設施,聲稱每年可進行310萬次受控活體人體組織實驗。這個數字反映平台的規模和產能,本身並不等於已證明實驗結果能準確預測臨床結果。37
公司在2023年宣布完成合共3,800萬美元種子輪融資,由Khosla Ventures領投,Kairos Ventures、CS Ventures、MBX Capital及Bison Ventures參與。9其後,Vivodyne再公布一輪4,000萬美元融資,用於擴展機械人及AI驅動的人體組織測試基礎設施。7
這套商業策略的重點,是把實驗生物學視為AI的基礎設施:先大量產生標準化數據,再用這些數據改善治療反應預測,以及決定下一步應該進行哪些實驗。
如果HIVE日後能在獨立、前瞻性的研究中證明具備預測力,可能影響藥物研發的幾個環節。
療效不足或毒性過高的候選藥物,可能在接觸病人之前已被降低優先級。這不會消除所有臨床失敗,但有機會減少證據不足的候選藥物進入試驗。
同時測試多個劑量和不同組織環境,或有助研究人員判斷哪些候選藥物值得推進,以及哪些劑量範圍值得在臨床研究中進一步檢驗。Vivodyne表示,其人體數據平台可應用於藥物發現、ADME/毒理研究,以及臨床試驗設計。13
一輪又一輪的「干預—反應」實驗,理論上可以向AI提供更清晰的資料,將某項治療與組織層面的生物結果連繫起來。Vivodyne長遠希望以此建立更大型的人類生物學計算模型,甚至稱為人體生物學的「世界模型」。8
但成敗取決於數據的質素、可重複性、樣本多樣性及外部驗證。實驗數量多,不代表一定更好;如果組織模型未能代表相關病人群組,或者量度指標與人體結果沒有關係,數據規模反而可能放大偏差。
複方治療需要同時探索多個變量,包括藥物配搭、劑量、用藥次序、時間,以及組織環境。人體組織平台或可令研究人員更實際地有系統測試這些組合,在病人接觸治療前尋找協同效果,同時篩查毒性。
對於單一藥物只能影響複雜生物通路其中一部分的疾病,這種能力尤其可能有用。不過,組織實驗能揭示的,始終主要是模型內的互動;臨床結果還會受到吸收、分布、代謝、免疫反應、器官互動,以及病人個體差異影響。
Vivodyne押注的方向,是AI製藥下一步的突破來自更好的實驗基礎,而不只是更大的演算法。HIVE以20種實驗室培養的人體組織進行高容量、受控測試,並把反應轉化為結構化生物數據。117
這個構想針對的是臨床前研究的一個真實弱點:在簡化系統上訓練或測試的模型,未必能可靠預測藥物在人身上的表現。Vivodyne公布的早期數字及平台產能確實引人注目,但現階段仍主要是公司自行公布的證據。
最關鍵的問題,將是HIVE的預測能否經獨立驗證,能否改善候選藥物選擇、減少臨床失敗,並且在超出訓練時使用的組織和藥物範圍後,仍然對人體生物學作出可靠推斷。
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Vivodyne認為,AI藥物研發的限制未必在於模型不夠大,而是缺乏受控、與人體高度相關的生物數據。
Vivodyne認為,AI藥物研發的限制未必在於模型不夠大,而是缺乏受控、與人體高度相關的生物數據。 公司表示,在20種化療藥物測試中,肝臟模型預測人體藥物毒性的準確率為94%,氣道組織匹配人體組織行為的比例為96%,骨髓模型則達到100%一致;但這些仍屬公司公布的結果,並非獨立臨床驗證。
Vivodyne稱旗下12個HIVE實驗室每年可進行310萬次活體人體組織實驗,長遠希望改善臨床試驗前的藥物篩選、人體生物學AI模型,以及複方治療的研發。