“99%相似度”是过时谣言？一文拆解关于人类与倭黑猩猩基因真相的争论

不，亚历山大最后的评论在本质上具有误导性。 事实是：“99%”是一个简化的、依赖上下文的数字；但将其曲解为“如今差异是16%”是错误的。

亚历山大说得对的部分

• 是的，像“99%相同”这样的单一百分比在涵盖整个基因组（包括插入、缺失、重复、重排和调控差异）时，确实是过于简化的。
• 严谨的论述指出，众所周知的98.8%数字并不能完全反映人与黑猩猩之间重要的基因组差异。

亚历山大说得不对的部分

• “99%相似性已经过时”或“是假消息”的说法，并不被科学主流所支持。
• 倭黑猩猩与人类在单拷贝常染色体区域的相似度约为98.7%；倭黑猩猩与黑猩猩之间则约为99.6%。
• 倭黑猩猩基因组研究证实，倭黑猩猩和黑猩猩是现存的与人类亲缘关系最近的物种。
• 该研究还发现，人类基因组中有超过3%的部分与倭黑猩猩或黑猩猩中的某一方更亲近，而倭黑猩猩与黑猩猩之间的亲密度反而次之。
• “如今人们将差异定为16%”这种说法并不严谨，因为它用另一种计算方法替换了已确立的对比数值。

关于“垃圾DNA”的论点

• 非编码DNA部分具有功能，但这并不能推翻98-99%的相似度数字，因为序列相似性和生物功能是两个不同的问题。
• 经典的98-99%数字指的是可比对、已对齐的DNA片段，而不是基因组中所有可能的结构、调控或功能差异。
• 亚历山大试图将基因组的复杂解读等于对高序列相似性的撤回——但这并不是事实。

关于Tomkins来源/创造论的定位

• 亚历山大引用的84%数字源自创造论圈子，与主流表述相冲突——后者仍将人与黑猩猩/人与倭黑猩猩在可比区域中的序列相似性定在约98-99%。
• 现有证据显示了来源冲突：一边是倭黑猩猩基因组学的专业出版物和科学综述；另一边是创造论文献，其将相似性描述得低得多。
• 这里更可靠的来源是基因组学的专业文献和科学综述，而非创造论的特殊解释。

简短回复

“不，99%并未被推翻；它指的是可比对的DNA片段。你所说的16%来自另一种计数方法，且出自创造论文献。基因组整体确实比单个百分比数字更复杂——但这并不会变成科学共识上的‘16%差异’。”

科学共识

主流科学界（如《科学》杂志、美国自然历史博物馆、哈佛大学生物数字库等）一致认为，人类与倭黑猩猩在可对齐的基因组区域中的序列相似度约为98.7%。 这一数据是理解人类演化关系的基础。

争议根源

争议主要源于计算方式的不同：

• 传统方法：仅比较可对齐的单拷贝常染色质区域，得出98-99%的相似度。
• 创造论方法（如Tomkins）：将重复序列、插入/缺失等也纳入总差异计算，从而得出80-85%的较低数字。
• 这两种方法回答的是不同问题，不能混为一谈。后者并未取代前者在科学领域中的标准地位。