藏在现代人DNA中的隐秘遗产：TRACE方法揭示两个未知古人类谱系

核心技术：TRACE

TRACE的全称是基于祖先重组图的计算方法，由加州大学伯克利分校的张玉林（Yulin Zhang）及其同事开发。传统方法需要依赖已知的古人类化石DNA（如尼安德特人样本）作为参照；TRACE则完全不需要任何古代参照基因组，仅通过解析现代人DNA内部的系谱关系，就能“嗅出”那些早已灭绝、甚至从未被发现的古人类基因留存。

这些古老基因有何作用？

研究团队发现，TRACE识别出的许多古老DNA片段都集中在与 免疫功能和代谢系统 相关的基因组区域。这提示这些来自“幽灵”祖先的基因或许曾被自然选择保留下来，因为它们可能帮助早期人类适应了新的病原体或饮食结构。

改写人类演化图景

长期以来，人类演化常被描绘成一棵简单的“家族树”：智人—尼安德特人—丹尼索瓦人各占一枝。但这项研究再次表明，真实的历史更像一张 交织的网络：不同人群之间反复发生迁徙、混合和杂交，每个活着的人都携带着来自多个古老人群的基因片段。

研究局限

需要指出的是，“幽灵”和“超级古老”谱系目前仍是基于现代基因组的 统计学重构，尚未有任何直接对应的化石或古DNA被发现。一些候选物种（如直立人）有可能是“超级古老”群体的代表，但这一推测尚未得到证实。