Порівняння з CRISPR звучить гучно, але тут важливо розрізняти схожість будови і доведену здатність редагувати гени. 23 вересня Anthropic оголосила, що її модель Claude помітила в генетичних даних незвичну систему. Далі знахідку досліджували люди в лабораторії. Що саме робить ця система, вчені поки не з’ясували.
1
3
15
Що саме знайшов Claude
Систему назвали ART — від англійського array-associated reverse transcriptases, тобто «зворотні транскриптази, пов’язані з масивами повторів». Її виявили в бактеріофагах — вірусах, що заражають бактерії. Поруч розташовані ген зворотної транскриптази, інший ген-партнер і довга ділянка повторюваної ДНК. Саме повтори нагадують одну зі структурних ознак систем CRISPR. Але подібний вигляд ще не означає подібної роботи.
9
12
15
Зворотна транскриптаза — це фермент, який створює ДНК на основі РНК. За повідомленнями про дослідження, сам фермент був відомий і раніше; увагу Claude привернуло його сусідство з іншим геном та повторами ДНК. Помітити таке поєднання — не те саме, що довести новий біохімічний механізм.
1
31
43
Як відбувався пошук
За словами Anthropic, дослідники дали Claude загальне завдання: шукати цікаві зворотні транскриптази у великій базі послідовностей ДНК. ШІ-агенти аналізували групи ферментів і відбирали варіанти для людей. Початковий напрям роботи визначили науковці компанії; лабораторні досліди також виконували вони.
15
Повідомлялося про приблизно 950 агентів, 21 годину роботи й 210 мільйонів токенів. За цими ж повідомленнями, пошук охопив понад 200 тисяч зворотних транскриптаз, після чого залишилося близько 3500 варіантів і 20 фіналістів.
8
9
11 Ці цифри показують масштаб аналізу, але доступні описи не дають змоги відтворити кожен крок відбору чи стверджувати, що для всіх 20 фіналістів було підготовлено докладні звіти.
Що підтвердили досліди
Лабораторні тести, за повідомленнями, показали, що ділянка повторів утворює короткі молекули РНК.
44 Це вже експериментальне спостереження, а не лише візерунок у базі даних. Проте воно не доводить, що ART може розпізнавати задану ділянку ДНК, розрізати її або керовано редагувати гени. Біологічна функція системи залишається невідомою.
3
15
44
Результати оприлюднили як препринт — роботу, що ще не пройшла незалежного рецензування.
20
44 Щоб оцінити значення ART, потрібні подальші експерименти, зокрема перевірка її механізму й незалежне відтворення результатів.
То це прорив чи ні?
Bloomberg повідомляв, що деякі фахівці вважають оцінку значення знахідки від Anthropic завищеною.
17 Мікробіолог Філіп Кранцуш у коментарі The New York Times сказав: «Це ще не прорив».
18
Водночас знецінювати результат теж зарано. Claude допоміг виділити незвичне поєднання, яке можна перевіряти в лабораторії.
15
44 Але повтори, схожі на CRISPR, і утворення коротких РНК — не доказ появи нового інструмента редагування генів. Наразі ART — перспективна, проте попередня біологічна знахідка, чию новизну, функцію та практичну цінність ще належить з’ясувати.
3
17