Araştırmacılar, önceki yaklaşımı "sokak lambasının altında anahtar aramak" olarak tanımlıyor . Bir genin düzenleyici etkisinin büyük bir kısmı, kromozom üzerinde kendisinden çok uzakta bulunan uzun mesafeli varyantlardan gelir. Standart GWAS araçları ise yalnızca bilinen genlerin hemen mahallesini tarar ve bu uzak ama kritik düzenleyici bağlantıları görmezden gelir
.
Yeni yöntem, bu uzun mesafeli düzenleyici ilişkileri yakalayarak standart analizlerde görünmez olan 641 yeni aday genin tespit edilmesini sağladı .
Bu keşfin neden bu kadar önemli olduğunu anlamak için alanın nasıl evrildiğine bakmak gerekiyor:
GWAS Dönemi (2000'ler – 2020'ler): Psikiyatri Genomik Konsorsiyumu (PGC) gibi büyük konsorsiyumlar, şizofreni ile ilişkili 108 farklı genetik lokus tanımladı ve hastalığın, küçük etkili yaygın varyantlar ve nadir kopya sayısı varyantlarını içeren oldukça poligenik bir bozukluk olduğunu ortaya koydu . Bu bulgular kritik bir ilk adımdı, ancak bunlar nedensel genler veya genlerin birlikte nasıl çalıştığına dair bir açıklama değil, sadece istatistiksel sinyallerdi
.
Erken Dönem Ağ Yaklaşımları (2010'lar – 2024): Önceki araştırmalar, şizofreniyle bağlantılı gen modülleri bulmak için birlikte ifade ağları ve protein-protein etkileşim ağlarını kullanmıştı . Lieber Enstitüsü daha önce şizofreni risk genlerinin hastalığa neden olmak için yaklaşık 20 diğer genle ortaklık kurması gerektiğini göstermiş
ve yakındaki genlerin, suç ortaklığı (guilt-by-association) etkisiyle kendi katkısal risklerini taşıdığını bulmuştu
. Ancak bu erken girişimler büyük ölçüde kısa mesafeli genomik etkileşimlerle sınırlıydı
.
Yeni Atılım: Yeni yöntem, birden fazla beyin bölgesindeki uzun mesafeli birlikte ifade ağlarını modelleyerek, istatistiksel GWAS 'isabetlerini' koordineli gen programlarının işlevsel bir haritasına dönüştürdü . Bu, 641 yeni aday geni ve spesifik biyolojik yolları ortaya çıkardı: glutamat sinyali, sinaptik iletişim, bağışıklık süreçleri ve beyin gelişimi
.
Bu bulgular, alanı kararlı bir şekilde ağ tabanlı hassas tıbba doğru yönlendiriyor. Şizofreniyi tek bir gen veya birkaç genin neden olduğu tek bir hastalık olarak ele almak yerine, sonuçlar bireysel hastaların farklı gen-ağı alt programlarında bozulmalar olabileceğini gösteriyor. Tedaviler nihayetinde kişinin spesifik ağ profiline göre uyarlanabilir .
Lieber Enstitüsü CEO'su Dr. Daniel Weinberger'in de belirttiği gibi: "Bu koordineli genetik programları anlamak, bizi, tedavilerin bireyin spesifik biyolojik profiline göre uyarlanabileceği hassas psikiyatriye yaklaştırıyor" .
Tanımlanan yollar - özellikle glutamat sinyali ve sinaptik fonksiyon - ayrıca yeni ilaç sınıfları geliştirmek için somut moleküler hedeflere işaret ediyor . Bu, alandaki paralel keşiflerle de örtüşüyor; örneğin, daha zayıf istatistiksel sinyallerden risk genlerini belirlemek için yeni teknikler
ve ZNF136 ile STAG1 gibi nadir gen mutasyonlarının şizofreni riskini nasıl artırdığının keşfi gibi
.
Bu ağ tabanlı yaklaşım, psikiyatrik genetikteki daha geniş bir değişimin parçası. Eş zamanlı olarak araştırmacılar, uzaktaki düzenleyici elementlerin gen ifadesini kontrol etmek için fiziksel olarak nasıl bir araya geldiğini anlamak için 3D kromatin haritalaması ve transkriptomik, nörogörüntüleme ve klinik verileri birleştiren çoklu-omik entegrasyonu
kullanıyor. Lieber Enstitüsü'nün bu atılımı, bir yol haritası sunuyor: Genetik risk faktörlerinin bir listesini, hastalığın işlevsel bir devre şemasına ve nihayetinde bireysel hastalar için kişiselleştirilmiş tedavilere dönüştürmek.
Comments
0 comments