มีรายงานผู้บาดเจ็บอย่างน้อย 50 ราย และมีผู้เข้ารับการรักษาในโรงพยาบาลหลายสิบคน สถานีโทรทัศน์สาธารณะ NHK รายงานว่าบ้านเรือน 12 หลังพังถล่ม และมีคน 4 คนติดอยู่ภายใน
นอกจากนี้ ศูนย์การค้าแห่งหนึ่งพังถล่มบางส่วนจนมีคนติดอยู่ด้านใน เจ้าหน้าที่ระบุว่ามีผู้ที่คาดว่าเสียชีวิต แต่ในช่วงค่ำของวันเดียวกันยังอยู่ระหว่างการตรวจสอบและยังไม่มีตัวเลขผู้เสียชีวิตที่ยืนยันอย่างเป็นทางการ
แรงสั่นสะเทือนทำให้ถนนหลายสายแตกร้าวหรือเปิดออก ทางหลวงได้รับความเสียหาย บ้านหลายหลังพังถล่ม และเกิดไฟไหม้ในพื้นที่ใกล้จุดศูนย์กลางแผ่นดินไหว
นายกรัฐมนตรีซานาเอะ ทาคาอิจิ ระบุว่า ทางการได้รับรายงานทั้งผู้บาดเจ็บ ไฟฟ้าดับ ไฟไหม้ รวมถึงความเสียหายต่อถนน สะพาน และอาคาร ขณะที่เจ้าหน้าที่ยังคงประเมินขอบเขตความเสียหายทั้งหมด
บริษัทไฟฟ้าคิวชูรายงานว่า บ้านเรือนและสถานประกอบการในภูมิภาคราว 45,000 แห่ง ไม่มีไฟฟ้าใช้หลังเกิดแผ่นดินไหว
หลังเกิดเหตุ JMA ออก คำแนะนำสึนามิ สำหรับพื้นที่ชายฝั่งทะเลอาริอาเกะและทะเลยัตสึชิโระ รวมถึงชายฝั่งตะวันตกของจังหวัดคุมะโมโตะ นางาซากิ ฟุกุโอกะ และซากะ โดยคาดว่าอาจมีคลื่นสูงถึง 1 เมตร
อย่างไรก็ตาม หลังไม่ตรวจพบสึนามิที่มีนัยสำคัญ ทางการยกเลิกคำแนะนำดังกล่าวภายในประมาณ 2 ชั่วโมง ศูนย์เตือนภัยสึนามิแปซิฟิกของสหรัฐฯ ระบุว่าไม่มีความเสี่ยงที่จะเกิดสึนามินอกชายฝั่งในพื้นที่ดังกล่าว
ไม่มีรายงานความผิดปกติที่ โรงไฟฟ้านิวเคลียร์เซนได ในจังหวัดคาโงชิมะ ซึ่งอยู่ห่างจากจุดศูนย์กลางแผ่นดินไหวประมาณ 100 กิโลเมตร และโรงไฟฟ้ายังคงเดินเครื่องตามปกติ
สำนักงานพลังงานปรมาณูระหว่างประเทศ (IAEA) ระบุว่าได้รับแจ้งจากหน่วยงานกำกับดูแลนิวเคลียร์ของญี่ปุ่นว่า ไม่พบความเสียหายหรือปัญหาด้านความปลอดภัยที่โรงไฟฟ้าเซนได ส่วน โรงไฟฟ้านิวเคลียร์เก็นไค ในจังหวัดซากะก็ไม่พบความผิดปกติเช่นกัน โดยระดับรังสีบริเวณโรงไฟฟ้าทั้งสองแห่งยังคงไม่เปลี่ยนแปลง
ท่าอากาศยานคุมะโมโตะปิดรันเวย์ชั่วคราว ทำให้สายการบินต้องเปลี่ยนเส้นทางหรือยกเลิกเที่ยวบินบางส่วน บริการรถไฟทั่วเกาะคิวชู รวมถึงรถไฟความเร็วสูงชินคันเซ็นและรถไฟท้องถิ่น ถูกระงับเพื่อให้เจ้าหน้าที่ตรวจสอบความปลอดภัย
ทางหลวงในหลายพื้นที่ได้รับความเสียหายและมีการปิดเส้นทางบางสาย ส่งผลให้การเดินทางและการขนส่งในภูมิภาคหยุดชะงัก
แผ่นดินไหวครั้งนี้เกิดขึ้นในระบบรอยเลื่อนฮินางุ–ฟุตางาวะ ซึ่งเป็นระบบรอยเลื่อนเดียวกับที่เกี่ยวข้องกับเหตุแผ่นดินไหวคุมะโมโตะครั้งใหญ่ในปี 2016
เหตุการณ์ปี 2016 มีขนาด Mw 7.1 หรือ Mj 7.3 และทำให้เกิดรอยเลื่อนบนพื้นผิวยาวประมาณ 40 กิโลเมตรตามแนวรอยเลื่อนฮินางุ–ฟุตางาวะ ซึ่งวางตัวในทิศตะวันออกเฉียงเหนือถึงตะวันตกเฉียงใต้ ส่วน USGS ระบุว่าแผ่นดินไหวปี 2026 เป็นการเลื่อนตัวของรอยเลื่อนในแนวระดับที่เกิดขึ้นตื้น ๆ ซึ่งสอดคล้องกับลักษณะทางธรณีวิทยาของเหตุการณ์ปี 2016
คณะกรรมการวิจัยแผ่นดินไหวของญี่ปุ่นยังติดตามกิจกรรมแผ่นดินไหวตามแนวรอยเลื่อนฮินางุและฟุตางาวะอย่างต่อเนื่องนับตั้งแต่ปี 2016 สะท้อนว่าพื้นที่นี้ยังคงมีการเคลื่อนไหวทางแผ่นดินไหวตลอดช่วงทศวรรษที่ผ่านมา
แผ่นดินไหวคุมะโมโตะปี 2016 ซึ่งเกิดเหตุสำคัญห่างกันประมาณ 28 ชั่วโมงในวันที่ 14 และ 16 เมษายน คร่าชีวิตผู้คน 228 ราย ตามข้อมูลของสำนักงานคณะรัฐมนตรีญี่ปุ่น