เพื่อมองเห็นปรากฏการณ์นี้ในระดับเซลล์เดี่ยว นักวิจัยใช้เทคโนโลยีใหม่ที่เรียกว่า GAGE-seq (Genome Architecture and Gene Expression sequencing) ซึ่งเป็นวิธีเซลล์เดี่ยวที่วัดสองสิ่งพร้อมกันในเซลล์เดียวกัน:
ทีมวิจัยยังได้บูรณาการการวัดเหล่านี้เข้ากับ แผนที่ทรานสคริปโตมเชิงพื้นที่ ของเนื้อเยื่อสมองส่วนที่สมบูรณ์ ทำให้สามารถระบุได้ว่าการเปลี่ยนแปลงเหล่านี้เกิดขึ้นบริเวณใดของสมอง
นอกเหนือจากการค้นพบเชิงทดลองแล้ว นักวิจัยยังได้สร้างเครื่องมือทางคอมพิวเตอร์เพื่อสำรวจว่าการเปลี่ยนแปลงโครงสร้างจีโนมส่งผลต่อการควบคุมยีนอย่างไร พวกเขาพัฒนา Hicformer ซึ่งเป็นโมเดล AI ชนิด深度学习 ที่วิเคราะห์:
Hicformer สามารถ ทำนายกิจกรรมของยีนที่จำเพาะต่อชนิดเซลล์ จากข้อมูลที่ป้อนเข้าไป นักวิจัยอธิบายว่านี่เป็นเหมือนสนามทดลองทางคอมพิวเตอร์เพื่อทำความเข้าใจว่าการเปลี่ยนแปลงของจีโนม 3 มิติอาจขับเคลื่อนการควบคุมยีนที่ผิดพลาดในโรคอัลไซเมอร์ได้อย่างไร
การศึกษานี้ให้มุมมองในระดับเซลล์เดี่ยวเป็นครั้งแรกว่าโรคอัลไซเมอร์ปรับเปลี่ยนโครงสร้างทางกายภาพของจีโนมภายในเซลล์สมองอย่างไร เนื่องจากการพับตัวของดีเอ็นเอ 3 มิติเป็นตัวควบคุมโดยตรงว่ายีนใดจะถูกแสดงออก การค้นพบ "compartment mingling" จึงเป็นเลนส์โมเลกุลใหม่ในการมองโรค การค้นพบนี้สามารถใช้เป็นแผนที่นำทางสำหรับการระบุเป้าหมายการรักษาที่จะฟื้นฟูการจัดระเบียบจีโนมและการแสดงออกของยีนในเซลล์ประสาทที่ได้รับผลกระทบ