Microsofts biologimodell Quine: lovande labbfynd, men ingen cancerbehandling

Quine är Microsoft Researchs experimentella försök att skapa en ”världsmodell” av biologin: ett system som kopplar samman olika slags biologiska belägg och hjälper forskare att utforska hur ett biologiskt system kan reagera på en viss påverkan. Det mest uppmärksammade exemplet hittills gäller bukspottkörtelcancer. Microsoft uppger att flera ämnen som Quine prioriterade har validerats i laboratoriet tillsammans med forskare vid Broad Institute. Det är ett forskningsresultat – inte en bevisad behandling. 2

Vad menas med en världsmodell av biologi?

Biologiska data beskriver olika saker och kan handla om allt från molekyler till celler. Quine tränas på att hitta gemensamma representationer i data om sekvenser, struktur, funktion, celltillstånd och bilder. Tanken är att information från en typ av data ska kunna bidra till förståelsen av en annan. 26

Med ”världsmodell” menas här en modell som försöker beskriva tillståndet i ett biologiskt system och förutsäga hur det kan förändras. Det betyder inte att Quine har en heltäckande eller slutgiltig modell av biologin. Microsoft beskriver systemet som experimentell forskningsteknik i ett tidigt skede och varnar för att resultaten kan vara ofullständiga eller felaktiga. 24

Från modell till laboratorieexperiment

Quine kombinerar modellen med ett interaktivt forskningsflöde som knyter ihop AI-modeller med vetenskapliga verktyg, litteratur, forskare och laboratoriearbete. 24 Avsikten är att forskare ska kunna utforska en fråga, hitta möjliga ingrepp och avgöra vilka experiment som bör prioriteras. Resultat från labbet kan sedan ge återkoppling när forskarna går vidare.

Skillnaden mellan en modellprognos och ett experimentellt resultat är viktig: Quine kan hjälpa forskare att välja vad de ska undersöka, men en förutsägelse är inte i sig en bekräftelse. Microsoft beskriver systemet som ett sätt att föra samman beräkningar och vetenskapligt arbete – inte som en ersättning för forskare eller laboratorietester. 2

Vad visade arbetet med bukspottkörtelcancer?

Tillsammans med forskare vid Broad Institute of MIT and Harvard använde Microsoft Quine för att prioritera ämnen som enligt modellens förutsägelser kunde förändra tumörcellers tillstånd i en riktning som bedöms relevant för behandling. Microsoft uppger att flera av de högst rankade kandidaterna validerades i flera laboratorietester. 2

Det är ett intressant forskningsfynd, men räckvidden ska inte överdrivas. Validering i laboratoriet visar inte att ämnena är säkra eller effektiva behandlingar för människor. Microsoft säger att Quine endast är avsett för forskning, inte för klinisk eller medicinsk användning. 2

Begränsningar, tillgång och Quine Fellows

Quine är fortfarande experimentellt. Resultaten behöver granskas av sakkunniga och prövas i experiment. Systemet presenteras varken som ett verktyg för kliniska beslut eller som en produkt som är allmänt tillgänglig. Microsoft säger att programmet Quine Fellows ska ge en grupp forskare tillgång till systemet och möjlighet att ge vetenskaplig återkoppling. 2

Den officiella sidan beskriver ett 16 veckor långt forskningsstipendium med ekonomiskt stöd, vid Microsoft Research i Cambridge i Massachusetts. Det riktar sig till doktorander, postdoktorer, forskare samt akademiska eller fristående forskare. 45 De tillgängliga uppgifterna bekräftar inte ansökningstidens start- och slutdatum eller när deltagarkullen genomför programmet. Kontrollera Quine Fellows officiella sida för aktuell information. 45

Den tydligaste slutsatsen är att Quine är en forskningsplattform som ska koppla samman biologiska data, beräkningsbaserade förutsägelser och experiment. Samarbetet med Broad Institute ger ett tidigt exempel på hur systemet kan hjälpa forskare att välja laboratorietester. De avgörande kliniska frågorna är däremot fortfarande obesvarade.