Главное в заявлении Anthropic — не появление «нового CRISPR», а найденная с помощью Claude зацепка для биологов. ИИ обратил внимание на необычное соседство генов и повторов ДНК у бактериофагов — вирусов, заражающих бактерии. Учёные проверили часть наблюдений в лаборатории, но что именно делает эта система, пока неизвестно.
1
3
15
Что обнаружил Claude
Anthropic назвала систему ART — от английского array-associated reverse transcriptases, то есть «обратные транскриптазы, связанные с массивом повторов». В описанной структуре рядом находятся ген обратной транскриптазы, ген другого белка и длинный участок повторяющейся ДНК. Повторы напоминают один из элементов систем CRISPR, известных прежде всего благодаря технологии редактирования генов. Сходство расположения элементов, однако, не означает сходства их работы.
9
12
15
Обратная транскриптаза — фермент, который копирует информацию из РНК в ДНК. Согласно сообщениям о находке, сам фермент был известен и раньше. Новым наблюдением стала его связь с соседним геном и массивом повторов; установить такую связь — не то же самое, что доказать новый механизм действия.
1
31
43
Как проходил поиск
По словам Anthropic, исследователи поставили Claude общую задачу: искать интересные обратные транскриптазы в большой базе последовательностей ДНК. ИИ-агенты изучали группы ферментов и отбирали варианты для рассмотрения людьми. Направление поиска задали учёные компании; лабораторные эксперименты тоже проводили они.
15
В публикациях приводятся такие масштабы работы: около 950 агентов, 21 час и 210 млн токенов. Сообщается, что поиск охватил более 200 тыс. обратных транскриптаз, после чего круг сузился примерно до 3,5 тыс. вариантов и 20 кандидатов.
8
9
11 По доступным описаниям нельзя восстановить каждый этап отбора или утверждать, что все 20 кандидатов были подробно описаны и экспериментально подтверждены.
Что подтвердили опыты — и чего не подтвердили
Лабораторные тесты, как сообщается, показали, что участок повторов служит источником коротких молекул РНК.
44 Это уже наблюдение в эксперименте, а не только закономерность в базе данных. Но оно не доказывает, что ART распознаёт заданные участки ДНК, разрезает их или поддаётся настройке для редактирования генов. Биологическая функция системы остаётся неизвестной.
3
15
44
Результаты представлены в виде препринта, ещё не прошедшего научное рецензирование.
20
44 Чтобы оценить значение находки, нужны независимое воспроизведение результатов и эксперименты, которые прояснят механизм работы ART.
Прорыв или перспективная зацепка?
Bloomberg сообщил, что некоторые сторонние специалисты сочли оценку значимости находки со стороны Anthropic преувеличенной.
17 Микробиолог Филип Кранцуш сказал The New York Times: «Это пока не прорыв».
18 Такая осторожность не обесценивает сам поиск: ИИ помог выделить объект, который можно изучать в лаборатории. Но сходство с CRISPR и образование коротких РНК пока не превращают ART в инструмент редактирования генов.
3
15
44