ESMFold2 é o mecanismo de previsão de estrutura acoplado à arquitetura ESM3. Ele prevê estruturas de proteínas em nível atômico diretamente da sequência de dados, com velocidade e precisão de ponta, sem precisar dos alinhamentos múltiplos de sequências que tornam os métodos tradicionais mais lentos . Essa agilidade é o que torna viável a cobertura estrutural em grande escala.
O ESM Atlas passou por uma expansão impressionante. O Atlas Metagenômico ESM original, lançado pelo laboratório FAIR da Meta, cobria cerca de 600 milhões de estruturas proteicas . O atlas atualizado do Biohub agora mapeia 6,8 bilhões de proteínas com 1,1 bilhão de estruturas previstas — uma expansão de uma ordem de magnitude que oferece uma visão estrutural de uma porção muito maior do universo das proteínas
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Além disso, o lançamento inclui o esm3-sm-open-v1, um modelo generativo treinado em 2,78 bilhões de proteínas naturais e expandido com dados sintéticos para 3,15 bilhões de sequências, 236 milhões de estruturas e 539 milhões de anotações de função, totalizando 771 bilhões de tokens . Este modelo é liberado sob uma licença não comercial para uso acadêmico e sem fins lucrativos
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A promessa prática está na velocidade e na escala. Projetar e validar um ligante proteico terapêutico tradicionalmente leva meses ou anos de trabalho iterativo e caro em laboratório. As ferramentas do Biohub comprimem esse processo para semanas ou até dias ao viabilizar três capacidades:
Uma crítica frequente às proteínas desenhadas por IA é que são bonitas no computador, mas falham no laboratório. O Biohub afirma que não é o caso aqui. Ligantes projetados inteiramente in silico usando esses modelos foram validados em experimentos reais — as proteínas criadas pela IA se ligaram de fato aos seus alvos pretendidos .
Alex Rives, chefe de ciência do Biohub, declarou que "esses modelos adquiriram uma representação tão precisa dos processos biológicos que é possível projetar computacionalmente interfaces proteicas e, em seguida, testá-las em laboratório com os resultados esperados" . Em termos práticos, significa que os modelos capturaram biologia fundamental suficiente para gerar projetos funcionais sem a necessidade de longos ciclos de otimização no laboratório.
Em 29 de abril de 2026, o Biohub anunciou a Iniciativa de Biologia Virtual (VBI), um compromisso de cinco anos e US$ 500 milhões para construir os conjuntos de dados multimodais e os modelos de IA necessários para criar modelos preditivos da célula humana . Desse total, US$ 100 milhões são destinados a coordenar esforços globais de geração de dados, e US$ 400 milhões vão para a geração própria de dados em larga escala e o desenvolvimento de tecnologias de última geração para medir, imagear e manipular sistemas biológicos
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O lançamento das ferramentas de biologia de proteínas é o primeiro grande resultado científico sob a égide da VBI. A iniciativa reúne alguns dos mais destacados parceiros institucionais em biologia e tecnologia do mundo, como o Broad Institute, Allen Institute, Arc Institute, Wellcome Sanger Institute, Human Cell Atlas, Human Protein Atlas, NVIDIA e Renaissance Philanthropy .
A família ESM não nasceu no Biohub. Ela foi originalmente desenvolvida no laboratório FAIR da Meta AI, que publicou os primeiros modelos ESM-1 e lançou o ESMFold original na revista Science em 2023, gerando as primeiras 600 milhões de previsões de estruturas proteicas . Esse trabalho produziu o primeiro ESM Metagenomic Atlas, que na época era o maior banco de dados de estruturas previstas em alta resolução, cerca de três vezes maior do que qualquer outro banco de dados de estruturas proteicas existente
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Quando a EvolutionaryScale, a startup formada pela equipe original do ESM no FAIR, se desmembrou da Meta, o Biohub absorveu e deu continuidade à pesquisa. Este lançamento de quarta geração é fruto direto dessa linhagem, com o Biohub agora liderando o desenvolvimento como um empreendimento de ciência aberta e filantrópica .
Pesquisadores podem experimentar e implementar essas ferramentas em múltiplas plataformas:
esm3-sm-open-v1 e ESMC 600M estão hospedados em huggingface.co/biohub/ sob uma licença de uso não comercial biohub.org/ai-models para explorar e baixar os modelos