Poważniejszym problemem jest usterka związana z łańcuchami pobocznych zadań Templar Hunt. Jeśli gracz pozostawi taką serię niedokończoną w jednym regionie, a następnie uruchomi w tym samym miejscu misję główną, obie linie zadań mogą się wzajemnie zablokować. Rezultatem jest softlock, czyli sytuacja, w której dalszy postęp staje się niemożliwy bez powrotu do wcześniejszego zapisu.
Dziennikarz Stephen Totilo poinformował, że przez ten błąd stracił pięć godzin rozgrywki . Do czasu wydania poprawki najbezpieczniejszym rozwiązaniem jest kończenie każdego łańcucha Templar Hunt od razu po jego otrzymaniu, zamiast odkładania go na później. Ubisoft potwierdził istnienie problemu i zapowiedział aktualizację .
Kolejnym źródłem krytyki stała się monetyzacja. Standardowa edycja gry kosztuje 60 dolarów, natomiast dostępne w dniu premiery opcjonalne pakiety DLC i mikrotransakcje mają łączną wartość około 84–85 dolarów . W ofercie znalazły się między innymi elementy kosmetyczne dla statku, stroje bohatera oraz mapy ułatwiające odnajdywanie ukrytych skarbów .
Gracze uznali taki model za przesadny w przypadku pełnopłatnego remake’u produkcji z 2013 roku. Ubisoft odpowiadał na negatywne recenzje na Steamie, podkreślając, że „dodatkowe pakiety są całkowicie opcjonalne” i „nigdy nie są wymagane, aby cieszyć się grą lub ją ukończyć” . Mimo to wiele opinii użytkowników wskazuje właśnie na monetyzację jako główny powód negatywnej lub mieszanej oceny, nawet jeśli sama jakość remake’u jest chwalona .
Gracze pecetowi napotkali również problem techniczny dotyczący przerywników filmowych. Są one blokowane do 30 klatek na sekundę, gdy Raytracing, BVH lub jakość terenu zostaną ustawione na poziomie Ultra High.
Ubisoft uznał to za znany problem i zaproponował tymczasowe obejście. Należy przywrócić ogólny profil grafiki do jednego z domyślnych ustawień, a następnie nie zmieniać ręcznie wspomnianych trzech opcji na Ultra High. Trwała poprawka ma pojawić się w późniejszej aktualizacji .
Assassin’s Creed Black Flag Resynced zadebiutowało 9 lipca 2026 roku. Produkcja zebrała generalnie pozytywne oceny krytyków — jej wynik w serwisie Metacritic wyniósł 84 punkty — i przyciągnęła na Steamie około 95–98 tysięcy graczy jednocześnie .
Reakcja użytkowników była jednak wyraźnie bardziej podzielona. W zależności od dnia odsetek pozytywnych recenzji wynosił około 42–65 proc., a ogólna ocena na Steamie wahała się między „W większości negatywne” a „Mieszane” . Na taki odbiór złożyły się cztery główne problemy: spoiler ujawniany przez Bazę Animusa, błąd mogący zablokować postęp, kosztowne dodatki obecne od dnia premiery oraz ograniczenie liczby klatek w pecetowych przerywnikach. Ubisoft odniósł się już do zarzutów dotyczących monetyzacji i potwierdził, że poprawki techniczne są w przygotowaniu.