Isu yang lebih serius melibatkan rangkaian misi sampingan Templar Hunt. Jika pemain meninggalkan misi itu separuh jalan di sesuatu kawasan, kemudian mencetuskan misi cerita utama di kawasan yang sama, kedua-dua rangkaian misi tersebut boleh “menghalang” satu sama lain.
Keadaan ini boleh menghasilkan softlock — permainan masih berjalan, tetapi pemain tidak dapat meneruskan misi seperti biasa dan terpaksa kembali kepada fail simpanan lebih lama. Wartawan Stephen Totilo dilaporkan kehilangan lima jam kemajuan akibat pepijat tersebut .
Buat sementara waktu, pemain disarankan menyiapkan setiap rangkaian Templar Hunt sebaik sahaja ia diterima dan tidak membiarkannya tergantung. Ubisoft telah mengakui masalah itu dan menyatakan bahawa pembaikan sedang disediakan .
Model monetisasi turut menjadi punca utama kemarahan pemain. Edisi standard permainan berharga $60, manakala pek DLC pilihan dan mikrotransaksi yang tersedia ketika pelancaran berjumlah kira-kira $84–$85 jika dikira bersama .
Kandungan berbayar itu merangkumi perkara seperti kosmetik kapal, pakaian watak dan peta untuk membantu mencari harta karun. Walaupun semuanya pilihan, sesetengah pemain menganggap jumlah tersebut keterlaluan untuk pembuatan semula permainan penuh harga yang asalnya dilancarkan pada 2013 .
Menjawab ulasan negatif di Steam, Ubisoft menegaskan bahawa “pek tambahan itu sepenuhnya pilihan” dan “tidak pernah menjadi syarat untuk menikmati atau menamatkan permainan” . Namun begitu, banyak ulasan pengguna tetap menyenaraikan monetisasi sebagai sebab utama mereka memberikan penilaian negatif atau bercampur-campur, walaupun kualiti pembuatan semula itu sendiri dipuji .
Pemain PC turut berdepan isu prestasi yang agak janggal untuk permainan keluaran 2026. Cutscene akan terkunci pada 30 FPS apabila tetapan Raytracing, BVH atau Terrain Quality ditetapkan kepada Ultra High .
Ubisoft sudah mengesahkan perkara ini sebagai isu yang diketahui. Penyelesaian sementara yang dicadangkan ialah menetapkan semula Overall Preset kepada mana-mana pratetap grafik lalai dan mengelakkan pelarasan manual tiga tetapan tersebut kepada tahap Ultra High. Pembaikan kekal dikatakan akan hadir tidak lama lagi .
Assassin’s Creed Black Flag Resynced dilancarkan pada 9 Julai 2026 dengan sambutan kritikan yang secara keseluruhannya positif. Permainan itu memperoleh skor 84 di Metacritic dan mencatat kira-kira 95,000 hingga 98,000 pemain serentak di Steam ketika pelancaran .
Namun, reaksi pemain jauh lebih berbelah bahagi. Penilaian pengguna Steam berubah antara “Mostly Negative” dan “Mixed”, dengan kira-kira 42% hingga 65% ulasan positif bergantung pada hari dan sumber yang dirujuk .
Empat isu utama — spoiler daripada Pangkalan Data Animus, pepijat Templar Hunt yang berisiko memadamkan kemajuan, kandungan berbayar yang banyak pada hari pertama dan cutscene PC yang dihadkan kepada 30 FPS — telah membayangi minggu pertama permainan ini. Ubisoft sudah memberi respons terhadap kritikan monetisasi serta mengesahkan bahawa pembaikan untuk isu teknikal sedang dalam proses.