TRACE(祖先組み換えグラフ法)は、カリフォルニア大学バークレー校の大学院生ユーリン・チャン(Yulin Zhang)氏らが開発したもので、化石の古代DNAを参照することなく、現代人のゲノムだけから古代人類との交雑の痕跡を検出できる点が画期的です。
特定された2系統は以下の通りです。
「幽霊(ゴースト)系統」 — 約80万年前に現生人類の祖先から分岐した古い人類集団で、現在生きているすべての人類のDNAに約0.5%から1%の割合で残っています。この系統はアフリカ出身者にもユーラシア出身者にも等しく見られ、地球規模の遺伝的シグナルであることが特徴です。
「超古代(スーパーアーカイック)系統」 — 約180万年前にさかのぼる極めて古い人類系統で、デニソワ人の祖先と交雑し、その後デニソワ人を通じてホモ・サピエンスに遺伝子が流入しました。この系統の候補としてはホモ・エレクトスが考えられますが、確証は得られていません。
TRACEが特定した古代DNA断片の多くは、免疫機能や代謝に関わるゲノム領域に集中しており、これらの交雑によって得られた遺伝子変異が、人類の環境適応に役立った可能性が示唆されています。
これらの発見は、人類の進化を単純な「系統樹」として描く従来のモデルを覆し、複数の人類集団が繰り返し移動し、交雑し、遺伝子を交換してきた「複雑な網の目」のような姿を浮き彫りにしています。
ただし注意点として、幽霊系統と超古代系統は現代人のゲノムからの統計学的な再構成であり、これらに直接結びつく化石や古代DNAはまだ発見されていません。