La tossicità della proteina ricombinante è un importante fattore di rischio.
La tossicità delle proteine ricombinanti in E. coli è un problema noto, che ha portato allo sviluppo di ceppi derivati da BL21 come C41(DE3) e C43(DE3), più adatti per l'espressione di proteine tossiche P.
In un modello di ingegneria metabolica con BL21(DE3), l'IPTG combinato con un substrato tossico ha causato uno stress fisiologico significativo. Ciò non significa che 'IPTG è tossico', ma dimostra che le condizioni di induzione possono aggravare uno stato cellulare già sotto stress P.
Conclusione più precisa per la domanda originale:
Se le cellule parentali, dopo un'induzione notturna, conservano ancora il plasmide di espressione intatto e funzionante, e se nelle successive nuove colture hanno generazioni sufficienti per ripristinare una crescita sana, in linea di principio possono essere re-indotte con IPTG nella fase finale della coltura principale.
Tuttavia, questa pratica aumenta la probabilità di un'espressione fallimentare, di una resa ridotta e di una maggiore variabilità tra lotti, specialmente in caso di plasmidi ad alto numero di copie, promotori forti, proteine tossiche, induzione prolungata a 37°C o alte concentrazioni di IPTG NPPP.
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A livello pratico, per verificare se un vostro lotto ha perso la capacità di induzione, il metodo più valido non è una deduzione teorica, ma un controlo diretto: isolare colonie singole dalla nuova coltura, verificare la resistenza all'antibiotico, effettuare un digesto/digestione di restrizione plasmidica o un sequenziamento, e confrontare l'espressione con un controllo non indotto usando SDS-PAGE o Western blot a parità di OD e condizioni di IPTG.