Selama pemakaman kenegaraan Ali Khamenei yang berlangsung selama sepekan (3–9 Juli 2026), perpecahan internal meledak menjadi konfrontasi terbuka. Para pelayat yang meneriakkan "mati bagi pengkhianat" mengepung Presiden Pezeshkian, sementara Menteri Luar Negeri Abbas Araghchi juga menjadi sasaran amukan massa garis keras . Bentrokan ini begitu parah sehingga para pelayat yang loyal pada IRGC secara fisik menyerang kedua pejabat tersebut, menurut sumber Israel dan Iran yang dikutip oleh Ynet dan Israel Hayom . Serangan ini dipandang sebagai upaya mengintimidasi pemerintahan sipil di tengah upaya diplomasi yang terus berlangsung .
Faktor paling destabilisasi dalam krisis ini mungkin adalah ketidakhadiran Pemimpin Tertinggi Iran yang baru, Mojtaba Khamenei, dalam waktu yang lama. Ia ditunjuk pada awal Maret 2026, hanya beberapa hari setelah ayahnya, Ali Khamenei, tewas dalam serangan udara AS-Israel pada 28 Februari . Sejak saat itu, ia tidak pernah muncul di publik atau merilis pernyataan video .
Sebuah nota kesepahaman gencatan senjata yang dimediasi oleh Pakistan ditandatangani pada pertengahan Juni 2026 . Gencatan senjata ini runtuh pada awal Juli setelah serangkaian eskalasi:
Krisis ini telah membagi kepemimpinan Iran secara tajam menjadi dua kubu :
Singkatnya, krisis saat ini didorong oleh tiga guncangan: pembunuhan mendadak Ali Khamenei dan cedera parah penggantinya, runtuhnya gencatan senjata rapuh dengan AS, dan perebutan kekuasaan sengit antara kelompok moderat yang mencari jalan keluar dari perang dan kelompok garis keras yang menganggap diplomasi sebagai pengkhianatan—semua ini terjadi tanpa seorang pemimpin tertinggi yang terlihat dan berfungsi untuk memaksakan persatuan.