Stok kopi bersertifikat di gudang ICE (Intercontinental Exchange) juga merosot tajam, memperparah ketatnya pasokan . Pedagang kopi Commercial mencatat bahwa pola cuaca El Niño sudah mulai mengancam ketatnya pasokan global . Pada 30 Juni, harga arabika mencatat kenaikan harian terkuat dalam beberapa bulan terakhir karena hujan terus mengganggu proses panen dan menimbulkan kekhawatiran akan kualitas biji . Harga robusta juga ikut terkerek naik karena kekhawatiran kondisi kering di Vietnam dan Indonesia — dua produsen robusta utama — yang dapat menekan hasil panen secara signifikan .
Pada akhir Juni, Pantai Gading untuk sementara menghentikan penjualan kontrak berjangka kako untuk panen 2026/27 sambil menunggu penilaian ulang hasil panen, dengan alasan ketidakpastian akibat El Niño . Langkah ini mendorong kontrak kakao New York dan London ke level tertinggi dalam lima bulan. New York kakao tercatat naik 73 poin (+1,59%) hanya pada 24 Juni .
Sebelumnya, hujan deras di Pantai Gading menyebabkan banjir yang memutus akses petani ke perkebunan. Pada akhir Mei, harga kakao New York melonjak 9,83% dalam satu sesi perdagangan akibat kekhawatiran banjir ini . Sebuah laporan Reuters mencatat Pantai Gading telah mengamankan sekitar 1 juta ton dalam perjanjian ekspor untuk panen utama dengan premi yang tinggi, menandakan ekspektasi pasar yang semakin ketat seiring mendekatnya El Niño . Afrika Barat, yang memproduksi sekitar setengah dari kakao dunia, sangat rentan terhadap perubahan pola curah hujan yang dibawa El Niño, termasuk hujan berlebihan yang diikuti kekeringan yang memicu penyakit tanaman .
Harga gula berjangka memperpanjang reli selama sepekan hingga awal Juli. Gula mentah #11 New York mencatat level tertinggi dalam 7 pekan, sementara gula putih London mencapai level tertinggi dalam 9,75 bulan terakhir karena kekhawatiran cuaca global . Munculnya El Niño diperkirakan akan membawa kondisi yang lebih kering bagi produsen gula di Asia-Pasifik (India, Thailand) dan hujan lebih deras di sebagian Amerika, mengancam wilayah perkebunan utama .
Ancaman 'Super El Niño' ini telah membuat para peramal merevisi ekspektasi awal tentang surplus gula global yang besar; proyeksi sekarang mengarah ke pasar yang datar atau bahkan defisit untuk musim 2026/27 . Lemahnya musim hujan di India — produsen gula terbesar kedua di dunia — telah menurunkan ekspektasi hasil gula, menambah kekhawatiran pasokan .
NOAA (Badan Kelautan dan Atmosfer Nasional AS) mengeluarkan Peringatan El Niño pada 11 Juni 2026, mengonfirmasi bahwa kondisi sedang berkembang, dengan probabilitas 63% menjadi episode yang sangat intens . Organisasi Meteorologi Dunia memperkirakan probabilitas 90% bahwa peristiwa ini akan bertahan hingga November, dan memperingatkan bahwa fenomena ini akan memperparah kekeringan, hujan lebat, dan gelombang panas .
'Super El Niño' (anomali suhu permukaan laut ≥+2,0°C) secara historis akan memperkuat volatilitas harga komoditas melalui guncangan pasokan regional di gula, kakao, dan kopi . Analis dari Neuberger Berman dan Citi melihat hal ini sebagai katalis utama yang mungkin masih belum sepenuhnya diperhitungkan oleh pasar . Ketiga komoditas ini sama-sama berasal dari daerah tropis — Brasil, Afrika Barat, dan Asia Tenggara — yang sangat rentan terhadap perubahan curah hujan dan suhu yang dibawa El Niño. Hal ini membuat gangguan pasokan secara simultan menjadi risiko sistemik, bukan hanya peristiwa yang terisolasi .