Para peneliti menggambarkan pendekatan sebelumnya sebagai "mencari cahaya di bawah lampu jalan" . Sebagian besar pengaruh regulasi suatu gen berasal dari varian jarak jauh yang terletak jauh di kromosom. Alat GWAS standar hanya memindai lingkungan terdekat dari gen yang dikenal, mengabaikan koneksi regulasi jarak jauh yang kritis ini
.
Metode baru menangkap hubungan regulasi jarak jauh ini, memungkinkan deteksi 641 gen kandidat baru yang sebelumnya tidak terlihat dalam analisis standar .
Untuk memahami mengapa penemuan ini penting, mari lihat bagaimana bidang ini berkembang:
Era GWAS (2000-an–2020-an): Konsorsium besar seperti Psychiatric Genomics Consortium mengidentifikasi 108 lokus genetik berbeda yang terkait dengan skizofrenia dan menetapkannya sebagai gangguan poligenik yang melibatkan varian umum dengan efek kecil dan varian salinan nomor langka . Temuan ini adalah langkah pertama yang kritis, tetapi mereka menghasilkan sinyal statistik—bukan gen penyebab atau penjelasan tentang bagaimana gen bekerja sama
.
Pendekatan jaringan awal (2010-an–2024): Penelitian sebelumnya menggunakan jaringan ko-ekspresi dan jaringan interaksi protein untuk menemukan modul gen yang terkait dengan skizofrenia . Lieber Institute sendiri sebelumnya telah menunjukkan bahwa gen risiko skizofrenia perlu bermitra dengan sekitar 20 gen lain untuk menghasilkan penyakit
, dan menemukan bahwa gen di dekatnya membawa risiko aditif mereka sendiri melalui efek "bersalah karena bergaul"
. Namun, upaya awal ini sebagian besar terbatas pada interaksi genomik jarak pendek
.
Kemajuan baru: Dengan memodelkan jaringan ko-ekspresi jarak jauh di beberapa wilayah otak, metode baru mengubah "pukulan" GWAS statistik menjadi peta fungsional program gen yang terkoordinasi . Ini mengungkap 641 gen kandidat baru dan jalur biologis spesifik: sinyal glutamat, komunikasi sinaptik, proses imun, dan perkembangan otak
.
Temuan ini dengan tegas menggerakkan bidang ini menuju obat presisi berbasis jaringan. Alih-alih memperlakukan skizofrenia sebagai satu penyakit yang disebabkan oleh satu atau beberapa gen, hasilnya menunjukkan bahwa pasien individu mungkin memiliki gangguan dalam subprogram jaringan gen yang berbeda. Perawatan pada akhirnya dapat disesuaikan dengan profil jaringan spesifik seseorang .
Seperti yang dikatakan Dr. Daniel Weinberger, CEO Lieber Institute: "Memahami program genetik yang terkoordinasi ini membawa kita lebih dekat ke psikiatri presisi, di mana perawatan dapat disesuaikan dengan profil biologis spesifik individu" .
Jalur yang teridentifikasi—khususnya sinyal glutamat dan fungsi sinaptik—juga menunjuk pada target molekuler yang konkret untuk mengembangkan kelas obat baru . Ini sejalan dengan penemuan paralel di bidang ini, termasuk teknik baru untuk mengidentifikasi gen risiko dari sinyal statistik yang lebih lemah
dan penemuan bagaimana mutasi gen langka seperti ZNF136 dan STAG1 mendorong risiko skizofrenia
.
Pendekatan berbasis jaringan ini adalah bagian dari pergeseran yang lebih luas dalam genetika psikiatri. Secara bersamaan, para peneliti menggunakan pemetaan kromatin 3D untuk memahami bagaimana elemen regulasi jarak jauh secara fisik berputar bersama untuk mengontrol ekspresi gen , dan integrasi multi-omik yang menggabungkan transkriptomik, neuroimaging, dan data klinis
. Terobosan Lieber Institute menyediakan peta jalan: mengubah daftar faktor risiko genetik menjadi diagram sirkuit fungsional penyakit—dan pada akhirnya, menjadi perawatan yang dipersonalisasi untuk pasien individu.
Comments
0 comments