कम से कम एक जहाज पर हमला हुआ और इसकी पुष्टि कई स्रोतों से हुई: पनामा ध्वज वाला टैंकर किकू (Kiku), जो कतर की राज्य-संचालित ऊर्जा कंपनी के लिए कच्चा तेल ले जा रहा था, 27 जून की सुबह जलडमरूमध्य से गुजरते समय एक अज्ञात प्रोजेक्टाइल से मारा गया । चालक दल के किसी सदस्य के हताहत होने या तेल रिसाव की कोई रिपोर्ट नहीं है
। CENTCOM ने कहा कि उसने जवाब में ईरानी 'निगरानी बुनियादी ढांचे, संचार प्रणालियों, वायु रक्षा साइटों, ड्रोन भंडारण सुविधाओं और माइनलेयर क्षमताओं' पर हमला किया
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एक अलग घटना में, सिंगापुर ध्वज वाले मालवाहक जहाज M/V Ever Lovely को CENTCOM के अनुसार, 25 जून को ओमानी तट के साथ जलडमरूमध्य से बाहर निकलते समय एक ईरानी वन-वे अटैक ड्रोन ने मारा । इस हमले ने संयुक्त राष्ट्र के अंतर्राष्ट्रीय समुद्री संगठन (IMO) को अपने निकासी अभियान को अस्थायी रूप से रोकने के लिए प्रेरित किया
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संयुक्त राष्ट्र के अंतर्राष्ट्रीय समुद्री संगठन (IMO) ने अनुमान लगाया कि होर्मुज जलडमरूमध्य के ऐतिहासिक शिपिंग मार्गों - विशेष रूप से मध्य गलियारे जिसे ट्रैफिक सेपरेशन स्कीम कहा जाता है - में लगभग 80 खदानें बनी हुई हैं । टैंकर मालिकों के व्यापारिक निकाय इंटरटैंको (Intertanko) ने पुष्टि की कि केंद्रीय क्षेत्र लगभग 80 खानों से अवरुद्ध है और इन्हें साफ किए जाने तक नियमित शिपिंग फिर से शुरू नहीं हो सकती
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खदानों के खतरे के कारण, ईरान युद्ध ने दो वैकल्पिक शिपिंग चैनलों के निर्माण को जन्म दिया: एक ओमान के तट से सटा हुआ और अमेरिका द्वारा समन्वित, और एक अलग तेहरान-नियंत्रित मार्ग जो ईरानी क्षेत्रीय जल के करीब है । ईरानी रिवोल्यूशनरी गार्ड (IRGC) ने चेतावनी दी कि निर्दिष्ट मार्गों के बाहर नेविगेशन 'अत्यंत खतरनाक और निषिद्ध' है और उन जहाजों के खिलाफ कार्रवाई की धमकी दी जो इस निर्देश की अनदेखी करते हैं
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होर्मुज जलडमरूमध्य से गुजरने वाले वाणिज्यिक जहाजों की बढ़ती संख्या अपने ऑटोमैटिक आइडेंटिफिकेशन सिस्टम (AIS) ट्रांसपोंडर बंद कर रही है, जिसे 'गोइंग डार्क' के रूप में जाना जाता है। यह जहाजों को ट्रैक करना कठिन बना देता है और वास्तविक यातायात की गणना कम कर सकता है ।
समुद्री खुफिया फर्म कप्लर (Kpler) के आंकड़ों से पता चलता है कि फारस की खाड़ी से भारत जाने वाले लगभग 62% टैंकरों और मालवाहक जहाजों ने जलडमरूमध्य को पार करते समय अपने ट्रांसपोंडर बंद कर दिए, एनडीटीवी की एक रिपोर्ट के अनुसार । यह विशिष्ट आंकड़ा एक ही स्रोत द्वारा समर्थित है; अन्य रिपोर्टों में पुष्टि की गई है कि डार्क ट्रांजिट बढ़ गए हैं, लेकिन विशेष रूप से भारत जाने वाले जहाजों के लिए 62% के आंकड़े की स्वतंत्र रूप से पुष्टि नहीं करते
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अमेरिका और ईरान ने 15 जून, 2026 को शत्रुता समाप्त करने और जलडमरूमध्य के माध्यम से वाणिज्यिक यातायात बहाल करने के उद्देश्य से एक समझौता ज्ञापन (एमओयू) पर हस्ताक्षर किए । यह समझौता 110 दिनों के व्यवधान के बाद हुआ जो 28 फरवरी को ईरान संघर्ष की शुरुआत के साथ शुरू हुआ
। संघर्ष विराम के बाद के सप्ताह में, 125 ट्रांजिट दर्ज किए गए, जो युद्ध शुरू होने के बाद से सबसे अधिक साप्ताहिक कुल था
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हालांकि, रिकवरी नाजुक साबित हुई। 25 जून को M/V Ever Lovely पर ड्रोन हमले ने मार्ग पर नई अनिश्चितता फेंक दी, संयुक्त राष्ट्र की निकासी योजना को रोक दिया और कुछ टैंकरों को वापस भेज दिया । 29 जून तक, जलडमरूमध्य के माध्यम से शिपिंग फिर से धीमी हो गई, रविवार को केवल 12 कमोडिटी जहाजों ने पार किया, जबकि शनिवार को 29 थे
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जलडमरूमध्य खुला रहता है, लेकिन इसका उपयोग करने वाले जहाजों की संख्या युद्ध-पूर्व के स्तर से काफी नीचे बनी हुई है, और खानों की उपस्थिति, आगे ड्रोन हमलों का जोखिम, और प्रतिस्पर्धी ईरानी और अमेरिकी-समन्वित रूटिंग योजनाएं सामान्य संचालन में वापसी में बाधा डालती रहती हैं ।