ביום שלישי, 21 ביולי, נפגע מקנולטי ממכונית בזמן שסייר את מסלול מרוץ הנגד-השעון של קטע 16, מאביאן-לה-בן לטונון-לה-בן . רכב שאינו קשור למירוץ הפיל אותו ארצה באירוע שתואר כתקרית של "זעם כביש" . מנהל הקבוצה, מאורו ג'יאנטי, אישר שלמקנולטי היו חבורות, אך בתחילה הוא נראה מסוגל להמשיך . ההשפעות המתמשכות של התאונה הזו - בשילוב עם דלקת הגרון שבאה לאחר מכן - תרמו לחוסר יכולתו להחזיק בקצב בקטע 18 .
ייטס נאבק בדלקת קיבה קשה מאז יום שלישי . הוא "הקיא מאז יום שלישי" ותואר כחיוור, מותש ורכון על הכידון לאחר שסיים את קטע 17 ביותר מ-26 דקות אחרי המנצח . מנהל הקבוצה מטקסין ג'וקסן פרננדז דיווח שייטס הקיא, קפא מקור ולא היה מסוגל לאכול . מנהל הקבוצה מאורו ג'יאנטי אמר בבוקר קטע 18 שבעיית הקיבה "כמעט נפתרה, אך הרגליים עשויות להיות מעט ריקות" , וכי הרופאים יחליטו אם ייטס יוכל להמשיך לבלוק ההרים הסופי .
הטור של 2026 הוא הפעם הראשונה ב-113 המהדורות שלו שאלפ ד'ואז יטופס לסיום פסגה בשני ימים רצופים - קטעים 19 ו-20 (24-25 ביולי) . קטע 19 הוא מסלול של 127.9 ק"מ מגאפ העושה שימוש בעלייה הקלאסית של 13.7 ק"מ בשיפוע ממוצע של 8.1%; קטע 20 מוסיף את קול דה לה קרואה דה פר, קול דה טלגרף וקול דו גליבייה לפני העלייה הסופית, עם סך של 5,600 מטרים של טיפוס .
עם עזיבתו של מקנולטי והיחלשותו הקשה של ייטס, גוף רוכבי התמיכה בהרים של פוגאצ'ר הצטמצם משמעותית. מקנולטי וייטס היו שני הרוכבים שתפקידם העיקרי היה לקצב את החולצה הצהובה בהרים הגבוהים . אייזק דל טורו הוא כעת הסגן העיקרי שנשאר, בעוד שגם טים ולנס אישר מחלה בתוך הסגל . הגרדיאן דיווח כי "מחנה איחוד האמירויות נסחף על ידי וירוס מאז יום המנוחה של יום שני", עם "גופות בכל מקום" . פוגאצ'ר עצמו ממעיט בחשיבות גל המחלות, אך העיתוי - כניסה לסוף שבוע כפול חסר תקדים באלפ ד'ואז - נתפס באופן נרחב כקריטי .
ביום ראשון, 12 ביולי, במהלך קטע 9 באוסל (קורז), רכב עיתונות של העיתון הצרפתי ל'אקיפ התנגש במחסומים כ-500 מטרים מקו הסיום, כ-20 דקות לפני הגעת הרוכבים . שמונה צופים נפצעו, אחד מהם במצב קשה (דחיפות מוחלטת) . הנהג סבל ככל הנראה מאירוע רפואי בהגה . המירוץ נמשך כמתוכנן .
הטור של 2026 ראה מספר גבוה במיוחד של נטישות. בעוד שתקציב החיפוש מוצה לפני ששאילתה ייעודית לגבי הרוכבים הנקובים יכלה להחזיר תוצאות, דף הנטישות הרשמי של הטור דה פראנס מפרט את כל הפרישות , ומקורות רבים מאשרים וירוס קיבה נפוץ בפלטון . נטישות מרכזיות שאושרו בדיווחים הזמינים כוללות:
גל הנגיף הרחב גרם לכמה קבוצות להפריד בין רוכבים חולים לבריאים והוביל לכותרות על פלטון "מלא בגופות בכל מקום" .