כדי לראות תופעה זו ברזולוציית תא בודד, החוקרים השתמשו בטכנולוגיה חדשה בשם GAGE-seq (ריצוף ארכיטקטורת גנום וביטוי גנים). שיטה זו מודדת בו-זמנית שני דברים באותו תא:
הצוות גם שילב מדידות אלו עם מפות טרנסקריפטומיות מרחביות של רקמת מוח שלמה, מה שאפשר להם לראות היכן במוח מתרחשים שינויים אלו .
מעבר לגילוי הניסויי, החוקרים בנו כלי חישובי לחקור כיצד שינויים מבניים בגנום משנים את ויסות הגנים. הם פיתחו את Hicformer, מודל AI מבוסס למידה עמוקה המנתח:
Hicformer יכול לנבא פעילות גנים ספציפית לתא מקלטים אלו. החוקרים תיארו אותו כמערכת ניסוי חישובית להבנה כיצד שינויים בגנום התלת-ממדי עלולים לגרום לשיבוש בוויסות גנים באלצהיימר .
מחקר זה מספק תצוגה ראשונה ברמת תא בודד של האופן שבו מחלת אלצהיימר משנה את הארכיטקטורה הפיזית של הגנום בתוך תאי המוח. מכיוון שהקיפול התלת-ממדי של DNA שולט ישירות באילו גנים באים לידי ביטוי, גילוי "ערבוב התאים" מציע עדשה מולקולרית חדשה להבנת המחלה. הממצאים עשויים לשמש מפת דרכים לזיהוי מטרות טיפוליות שישקמו את הארגון התקין של הגנום וביטוי הגנים בתאי עצב פגועים .