Mardi 21 juillet, McNulty a été percuté par une voiture alors qu'il reconnaissait le parcours du contre-la-montre de la 16e étape entre Évian-les-Bains et Thonon-les-Bains . Un véhicule sans lien avec la course l'a projeté au sol dans ce qui a été décrit comme un incident de « rage au volant » . Le manager général Mauro Gianetti a confirmé que McNulty avait des contusions, mais qu'il semblait initialement pouvoir continuer . Les effets persistants de cet accident, combinés au mal de gorge, ont contribué à son incapacité à suivre le rythme lors de la 18e étape .
Yates lutte contre une sévère gastro-entérite depuis mardi . Il « vomit depuis mardi » et a été décrit comme pâle, épuisé et affalé sur son guidon après avoir terminé la 17e étape avec plus de 26 minutes de retard . Le directeur sportif Matxin Joxean Fernández a rapporté que Yates vomissait, avait froid et était incapable de s'alimenter . Mauro Gianetti a déclaré le matin de la 18e étape que « son problème d'estomac est presque résolu, mais les jambes sont peut-être un peu vides » , et que les médecins décideraient si Yates pouvait continuer dans le bloc montagnard final .
Le Tour 2026 est la première fois en 113 éditions que l'Alpe d'Huez sera gravie avec une arrivée au sommet deux jours consécutifs — les étapes 19 et 20 (24-25 juillet) . L'étape 19 est un parcours de 127,9 km au départ de Gap avec l'ascension classique de 13,7 km à 8,1 % de pente moyenne ; l'étape 20 ajoute le Col de la Croix de Fer, le Col de la Télégraphe et le Col du Galibier avant l'ascension finale, totalisant 5 600 m de dénivelé .
Avec McNulty hors course et Yates sévèrement affaibli, le corps des équipiers de montagne de Pogačar est effectivement réduit. McNulty et Yates étaient les deux coureurs dont le rôle principal était d'emmener le maillot jaune dans les hautes montagnes . Isaac del Toro est désormais le principal lieutenant restant, tandis que Tim Wellens a également confirmé être malade au sein de l'équipe . The Guardian a rapporté que le camp UAE « a été envahi par un virus depuis le jour de repos de lundi », avec « des corps partout » . Pogačar lui-même a minimisé la vague de maladie, mais le timing — à l'aube d'un week-end inédit avec un double Alpe d'Huez — est largement considéré comme critique .
Dimanche 12 juillet, lors de la 9e étape à Ussel (Corrèze), un véhicule de presse du journal sportif français L'Équipe a percuté des barrières à moins de 500 mètres de la ligne d'arrivée, environ 20 minutes avant l'arrivée des coureurs . Huit spectateurs ont été blessés, dont un en urgence absolue (état grave) . Le conducteur aurait été victime d'un malaise au volant . La course s'est déroulée comme prévu .
Le Tour 2026 a connu un nombre exceptionnellement élevé d'abandons. Si la recherche dédiée n'a pas pu retourner de résultats pour tous les coureurs nommés, plusieurs sources confirment un virus intestinal généralisé dans le peloton . Les principaux abandons confirmés dans les rapports disponibles incluent :
La vague virale a incité certaines équipes à isoler les coureurs malades des coureurs sains et a conduit à des titres évoquant un peloton « plein de corps partout » .