Dès le lendemain, l'armée pakistanaise a lancé ce qu'elle a décrit comme une opération terrestre « basée sur le renseignement » dans le district de Bajaur, de son côté de la frontière, suivie de « frappes calibrées » — y compris des frappes aériennes de précision — de l'autre côté de la frontière, en Afghanistan . Le ministre de l'Information, Attaullah Tarar, a confirmé que trois cibles dans les provinces afghanes de Paktia, Paktika et Kunar avaient été détruites .
Au lendemain de l'attaque de Karachi et des frappes transfrontalières, des responsables pakistanais ont allégué que l'attaque avait été perpétrée par une « ombre indienne » . Cette accusation s'inscrit dans un schéma bien établi : le Pakistan affirme régulièrement que l'Inde soutient des groupes militants opérant depuis le territoire afghan contre le Pakistan .
La réponse de l'Inde a été rapide et sans équivoque. Randhir Jaiswal, porte-parole du ministère des Affaires étrangères, a qualifié ces allégations de « sans fondement » et a invité les autorités pakistanaises à « s'examiner de l'intérieur » et à prendre des mesures crédibles contre les infrastructures terroristes sur leur propre sol au lieu de blâmer les autres .
L'Inde a également condamné les frappes transfrontalières elles-mêmes. Aux Nations unies, le 9 juin 2026, l'Inde a accusé le Pakistan de violer la souveraineté afghane et de causer des pertes civiles . Plus tôt dans le conflit, l'Inde avait décrit les frappes aériennes pakistanaises comme une tentative d'« externaliser ses lacunes internes » .
Mise en garde importante : Il s'agit de déclarations du gouvernement indien. Il n'existe aucune preuve publique indépendante qui confirme ou infirme l'allégation spécifique du Pakistan concernant une ombre indienne dans l'attaque de Karachi. Cette allégation reste contestée.
Les frappes de juin 2026 ne peuvent être comprises isolément. Elles constituent la dernière et l'une des plus grandes flambées d'un conflit qui s'est intensifié régulièrement depuis l'effondrement d'une trêve négociée.
Après certains des affrontements frontaliers les plus meurtriers depuis des années, une trêve a été négociée par la Turquie et le Qatar à la fin du mois d'octobre 2025. Les deux parties ont accepté de la prolonger lors de pourparlers à Istanbul qui comprenaient un mécanisme de suivi et de vérification .
Les pourparlers ont échoué presque immédiatement. Le porte-parole des talibans, Zabihullah Mujahid, a annoncé le 8 novembre que les négociations avaient échoué, principalement parce que le Pakistan insistait pour que les talibans afghans prennent des mesures contre le TTP — une demande que Kaboul a rejetée comme dépassant sa « capacité » . La trêve a tenu sur le papier mais est devenue de plus en plus creuse.
La trêve a volé en éclats violemment les 26 et 27 février, lorsque le Pakistan a lancé des frappes aériennes contre des installations militaires talibanes à Kaboul, Kandahar et Paktia, les présentant comme des représailles aux attaques transfrontalières du TTP. Le ministre de la Défense pakistanais, Khawaja Asif, a publiquement déclaré que les deux pays étaient désormais en « guerre ouverte » . L'Afghanistan a riposté par des tirs frontaliers et ses propres frappes .
Une brève trêve en mars, annoncée avant l'Aïd al-Fitr, a expiré et a été suivie de nouveaux combats qui ont tué au moins deux civils dans la province de Kunar . Une attaque majeure du TTP contre un avant-poste de sécurité pakistanais en mai a tué plusieurs paramilitaires, érodant davantage toute retenue restante .
Quelques jours avant l'attaque de Karachi, l'Afghanistan a lancé des assauts aériens contre ce qu'il a appelé des cachettes de militants et des « entités de renseignement hostiles » à l'intérieur du Pakistan, portant les tensions à un nouveau sommet .
L'opération terrestre et les frappes de précision du Pakistan tuant 29 militants représentent la plus grande opération transfrontalière unique depuis la déclaration de « guerre ouverte » en février .
La trêve de 2025 n'a jamais abouti à un règlement politique. Elle a commencé à s'effriter presque immédiatement après l'effondrement des pourparlers en novembre 2025, a été violemment brisée en février 2026, et a été remplacée par un cycle d'incursions et de représailles qui s'intensifient. Les frappes de juin 2026 ne sont pas un incident isolé — elles sont la continuation d'un schéma qui ne montre aucun signe de désescalade.