Quine voi auttaa löytämään tutkittavia yhdisteitä, mutta ei vielä hoida syöpää

Microsoft Researchin Quine on kokeellinen hanke, jossa kehitetään biologian niin sanottua maailmamallia. Tavoitteena on yhdistää monenlaista biologista näyttöä, jotta tutkijat voisivat tutkia, miten biologinen järjestelmä saattaa reagoida tiettyyn muutokseen. Haimasyöpään liittyvä keskeinen tulos on tutkimushavainto, ei todistettu hoito: Microsoftin mukaan Broad-instituutin tutkijoiden kanssa useita tekoälyn priorisoimia yhdisteitä validoitiin laboratoriokokeissa. 2

Mitä biologian ”maailmamalli” tarkoittaa?

Biologista tietoa kertyy monessa muodossa ja eri mittakaavoissa. Quine pyrkii oppimaan yhteisiä esitystapoja muun muassa sekvenssi-, rakenne-, toiminta-, solutila- ja kuvantamisdatasta. Tarkoitus on yhdistää eri aineistoista saatavia havaintoja. 26

”Maailmamalli” kuvaa tavoitetta: järjestelmä esittäisi biologisen järjestelmän tilaa ja ennakoisi, miten se voisi muuttua. Se ei tarkoita, että Quine olisi valmis tai kattava biologian malli. Microsoft kuvaa sitä varhaisen vaiheen kokeelliseksi tutkimusteknologiaksi, jonka tulokset voivat olla puutteellisia tai virheellisiä. 24

Tekoälystä laboratoriokokeisiin

Quine-malliin kuuluu vuorovaikutteinen tutkimusympäristö, joka yhdistää tekoälymalleja tieteellisiin työkaluihin, kirjallisuuteen, tutkijoihin ja laboratoriotyöhön. 24 Ajatuksena on, että tutkijat voivat käyttää näitä yhteyksiä tutkimuskysymyksen tarkasteluun, mahdollisten vaikutustapojen löytämiseen ja kokeiden priorisointiin. Laboratoriotulokset puolestaan voivat antaa tutkijoille palautetta jatkotutkimusta varten.

Olennainen ero on tämä: järjestelmä voi auttaa päättämään, mitä kannattaa tutkia, mutta mallin ennuste ei itsessään ole kokeellinen vahvistus. Microsoft esittelee Quinen keinona yhdistää laskennallista analyysiä ja tieteellistä työtä – ei tutkijoiden tai laboratoriovalidoinnin korvaajana. 2

Mitä haimasyöpää koskevassa tutkimuksessa havaittiin?

Microsoft käytti Quinea yhdessä MIT:n ja Harvardin yhteydessä toimivan Broad-instituutin tutkijoiden kanssa yhdisteiden priorisointiin. Järjestelmä ehdotti yhdisteitä, joiden ennustettiin siirtävän haimakasvainsoluja hoidon kannalta kiinnostaviin tiloihin. Microsoft kertoo, että useita kärkeen sijoittuneita ehdokkaita validoitiin useissa laboratoriokokeissa. 2

Tulos on lupaava tutkimushavainto, mutta sen merkitystä ei pidä venyttää pidemmälle kuin näyttö antaa myöten. Kyse on laboratoriossa saadusta näytöstä, joka ei osoita yhdisteiden olevan turvallisia tai tehokkaita potilaille. Microsoftin mukaan Quine on tarkoitettu vain tutkimuskäyttöön, ei kliiniseen tai lääketieteelliseen käyttöön. 2

Rajoitukset ja tutkijoiden pääsy järjestelmään

Quine on yhä kokeellinen, ja sen tulokset vaativat asiantuntijoiden arviointia sekä kokeellista vahvistamista. Sitä ei esitellä kliinisen päätöksenteon työkaluna eikä yleisesti saatavilla olevana tuotteena. Microsoftin Quine Fellows -ohjelma tarjoaa tutkijaryhmälle pääsyn järjestelmään ja mahdollisuuden antaa siitä tieteellistä palautetta. 2

Ohjelman virallisella sivulla kuvataan 16 viikon tutkimusapurahaohjelma, johon kuuluu taloudellista tukea. Se järjestetään Microsoft Researchin tiloissa Cambridgessa Massachusettsissa, ja se on suunnattu tohtoriopiskelijoille, tutkijatohtoreille, tutkimustieteilijöille sekä akateemisille tai itsenäisille tutkijoille. 45 Saatavilla olevat sivutiedot eivät vahvista hakemusten avautumis- ja päättymispäiviä tai ohjelman aikataulua, joten ajantasaiset tiedot kannattaa tarkistaa Quine Fellows -sivulta. 45

Yhteenvetona Quine on tutkimusalusta, joka pyrkii yhdistämään biologista dataa, laskennallisia ennusteita ja kokeita. Yhteistyö Broad-instituutin kanssa tarjoaa varhaisen esimerkin siitä, miten tällainen lähestymistapa voi auttaa valitsemaan laboratoriossa tutkittavia kohteita. Kliiniset kysymykset – kuten mahdollinen turvallisuus ja teho ihmisillä – ovat kuitenkin yhä avoinna.