Tiistaina 21. heinäkuuta McNulty jäi auton alle tutkiessaan 16. etapin aika-ajoreittiä Évian-les-Bainsista Thonon-les-Bainsiin . Kilpailuun liittymätön auto kaatoi hänet maahan. Tapausta kuvailtiin törkeäksi liikennekäyttäytymiseksi . Tallipäällikkö Mauro Gianetti vahvisti, että McNultylla oli mustelmia, mutta hän vaikutti aluksi pystyvän jatkamaan . Törmäyksen pitkittyneet vaikutukset – yhdistettynä myöhempään kurkkukipuun – vaikuttivat siihen, ettei McNulty pystynyt pitämään vauhtia 18. etapilla .
Yates on kärsinyt pahasta gastroenteriitistä tiistaista lähtien . Hän on "oksentanut tiistaista asti" ja häntä kuvailtiin kalpeaksi, uupuneeksi ja kumaraan taipuneeksi ohjaustangon ylle, kun hän ylitti maaliviivan 17. etapilla yli 26 minuuttia voittajalle hävinneenä . Tiimin johtaja Matxin Joxean Fernández kertoi Yatesin oksentaneen, palelleen ja olleen syömättä . Tallipäällikkö Mauro Gianetti sanoi 18. etapin aamuna, että vatsaongelma oli "melkein selätetty, mutta jalat saattavat olla hieman tyhjät" , ja että lääkärit päättäisivät, voiko Yates jatkaa viimeisille vuoristoetapeille .
Vuoden 2026 Tour on ensimmäinen kerta kisan 113:n edition aikana, kun Alpe d’Huezille noustaan maaliintuloon kahtena peräkkäisenä päivänä – etapeilla 19 ja 20 (24.–25. heinäkuuta) . Etappi 19 on 127,9 km:n reitti Gapista, ja se nousee klassista 13,7 km pitkää, keskimäärin 8,1 prosentin nousua . Etappi 20 lisää reitille Col de la Croix de Ferin, Col de la Télégraphen ja Col du Galibierin ennen viimeistä nousua, ja nousumetrejä kertyy yhteensä 5 600 .
McNultyn poissa ollessa ja Yatesin ollessa pahoin heikentynyt Pogačarin vuoristoapumiesten määrä on käytännössä vähentynyt. McNulty ja Yates olivat ne kaksi ajajaa, joiden ensisijainen tehtävä oli vauhdittaa keltaista paitaa korkeilla vuorilla . Isaac del Toro on nyt tärkein jäljellä oleva luutnantti, kun taas Tim Wellens on vahvistanut oman sairastumisensa tallissa . The Guardian raportoi UAE:n leirin "joutuneen viruksen valtaamaksi maanantain lepopäivästä lähtien", ja leirillä on "ruumiita kaikkialla" . Pogačar itse on vähätellyt sairausaaltoa, mutta ajoitus – juuri ennen ennennäkemätöntä tupla-Alpe d’Huez -viikonloppua – nähdään laajalti kriittisenä .
Sunnuntaina 12. heinäkuuta 9. etapilla Usselissa (Corrèze) ranskalaisen urheilulehden L’Équipen lehtiauto törmäsi aitoihin alle 500 metrin päässä maaliviivasta, noin 20 minuuttia ennen kuin ajajat saapuivat paikalle . Kahdeksan katsojaa loukkaantui, joista yksi oli vakavassa tilassa . Kuljettajan kerrottiin saaneen sairaskohtauksen ratin takana . Kilpailua jatkettiin aikataulun mukaisesti .
Vuoden 2026 Tourilla on nähty poikkeuksellisen paljon keskeytyksiä. Vaikka hakutulokset eivät palauttaneet kaikkia nimettyjä ajajia koskevaa tietoa, virallinen Tour de Francen keskeytyssivu listaa kaikki poisjääneet , ja useat lähteet vahvistavat laajan vatsataudin vaivaavan peletonia . Saatavilla olevien raporttien perusteella vahvistettuja suuria keskeytyksiä ovat:
Laaja virusaalto on saanut jotkut tallit eristämään sairaat ajajat terveistä, ja otsikoissa on puhuttu peletonin olevan "täynnä ruumiita kaikkialla" .