Quine od Microsoftu hledá souvislosti v biologii. Zatím ale není lékem ani nástrojem pro lékaře

Quine je experimentální projekt Microsoft Research, který se snaží vytvořit „model světa“ biologie: systém propojující různé druhy biologických poznatků, aby vědcům pomohl zkoumat, jak by biologický systém mohl reagovat na určitý zásah. Nejvýraznější dosavadní výsledek se týká rakoviny slinivky. Microsoft uvádí, že několik látek vybraných pomocí Quine ověřili výzkumníci ve spolupráci s Broad Institute v laboratorních testech. Neznamená to ale, že jde o potvrzenou léčbu. 2

Co si představit pod „modelem světa“ biologie

Biologická data mají různé podoby a popisují děje v různých měřítkách. Quine se učí společné reprezentace z údajů o sekvencích, struktuře a funkci, buněčném stavu i ze zobrazovacích dat. Cílem je propojovat poznatky, které by při pohledu na každý typ dat zvlášť nemusely být zřejmé. 26

Označení „model světa“ popisuje ambici systému zachytit stav biologického systému a předvídat, jak by se mohl změnit. Neznamená to, že Quine představuje úplný nebo definitivní model biologie. Microsoft projekt označuje za ranou fázi experimentálního výzkumu a upozorňuje, že jeho výstupy mohou být neúplné či nepřesné. 24

Od výpočtu k laboratornímu ověření

Quine nespoléhá jen na samotný model. Microsoft jej spojuje s interaktivním výzkumným prostředím, které propojuje modely s vědeckými nástroji, odbornou literaturou, výzkumníky a laboratorní prací. 24 Záměrem je, aby vědci mohli zkoumat otázku, vytipovat možné zásahy a určit, které experimenty stojí za to provést. Výsledky z laboratoře pak mohou pomoci dalšímu výzkumu.

Rozdíl mezi předpovědí a potvrzením je zásadní: Quine může vědcům pomoci vybrat, co zkoumat, ale samotný výsledek modelu není experimentálním důkazem. Microsoft popisuje systém jako způsob, jak propojit výpočetní postupy s vědeckou praxí, nikoli jako náhradu výzkumníků nebo laboratorního ověření. 2

Co ukázalo zkoumání látek u rakoviny slinivky

Ve spolupráci s výzkumníky z Broad Institute of MIT and Harvard použil Microsoft Quine k výběru látek, u nichž systém předpovídal, že by mohly posunout nádorové buňky slinivky do stavů považovaných za relevantní pro léčbu. Microsoft uvádí, že několik nejvýše hodnocených kandidátů bylo ověřeno v několika laboratorních testech. 2

Jde o výsledek z laboratorního výzkumu, jehož význam není radno přeceňovat. Neprokazuje, že jsou dané látky bezpečné nebo účinné jako léčba pro pacienty. Microsoft výslovně uvádí, že Quine je určen pouze pro výzkum, nikoli pro klinické či lékařské použití. 2

Limity systému a program Quine Fellows

Quine je stále experimentální nástroj. Jeho výstupy vyžadují odborné posouzení a ověření experimentem; Microsoft jej nepředstavuje jako pomůcku pro klinické rozhodování ani jako produkt obecně dostupný veřejnosti. Společnost plánuje zpřístupnit systém skupině vědců v rámci programu Quine Fellows, která má zároveň poskytovat vědeckou zpětnou vazbu. 2

Oficiální stránka programu popisuje 16týdenní výzkumné stipendium s finanční podporou, které pořádá Microsoft Research v Cambridge ve státě Massachusetts. Určeno je doktorandům, postdoktorandům, výzkumným pracovníkům a akademickým či nezávislým badatelům. 45 Dostupné informace nepotvrzují termíny zahájení a ukončení přihlášek ani harmonogram kohorty; aktuální údaje je proto třeba ověřit na oficiální stránce Quine Fellows. 45

Hlavní přínos Quine zatím spočívá v propojování biologických dat, výpočetních předpovědí a experimentů. Spolupráce s Broad Institute ukazuje jeden z možných způsobů, jak může systém pomoci zúžit výběr látek k testování. Otázky, zda z těchto kandidátů vznikne účinná léčba a jak by fungovala u pacientů, však zůstávají otevřené.