Základní změnou je, že všichni občané nečlenských zemí EU (včetně Britů) musí nyní při prvním vstupu poskytnout otisky prstů a sken obličeje, které se zaznamenávají digitálně namísto dřívějšího razítkování pasů . Každá biometrická registrace trvá 1–2 minuty na osobu, a když musí každý cestující ve frontě podstoupit biometrii poprvé, čekací doby vzrostly na 1–6 hodin na frekventovaných letištích a hraničních přechodech . Postupné zavádění systému — s různými přístavy v různé fázi připravenosti — způsobilo zmatek, protože některé hraniční přechody jsou plně biometrické, zatímco jiné stále využívají dočasné výjimky, což vede k nekonzistentní rychlosti odbavení . Důležité je, že neexistuje kompenzace typu EU261 za zpoždění na hranicích: pravidla pro práva cestujících se nevztahují na čekací doby u pasové kontroly, takže cestující uvízlí ve frontách EES nemají automatický nárok na finanční odškodnění od leteckých společností ani hraničních úřadů .
Spojené království
Španělsko
Širší kontext práv cestujících v EU: Evropský parlament v červenci 2026 zachoval stávající úrovně kompenzací pro letecké cestující (250–600 eur podle vzdálenosti) za zpoždění a zrušení letů, ale tato pravidla se nevztahují na zpoždění způsobená hraničními kontrolami EES .